主动脉硬化

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TUhjnbcbe - 2021/4/25 23:56:00
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随着单细胞测序技术的成熟,应用领域越来越广泛,引得无数科研人员聚焦于单细胞研究领域。早期单纯的单细胞测序就可以发表不错的高质量文章,但目前大家都在争相模仿很难做出新的亮点,提高文章档次。这里我们不妨从多组学出发,将单细胞结合空间转录组、ATAC、Hi-C、免疫组库等多技术联合分析,不仅可以使文章内容更加丰富,还能从多种角度深层次挖掘疾病机理、生命活动过程,让您的文章与众不同创新高。今天给大家分享一篇发表在CirculationResearch杂志利用单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq技术探讨人类动脉粥样硬化斑块的转录和表观基因组特征,我们一起来看看文章整体研究思路。

目的

利用单细胞转录学和染色质可及性,更好地了解人类动脉粥样硬化的病理生理机制。

从文中得到了什么?

动脉粥样硬化病变有着复杂的细胞成分,可以使用选定的标记分子进行研究。

在小鼠和人类动脉粥样硬化中,使用单细胞RNA测序的方法利于对免疫细胞展开研究。

文中提供了哪些新信息?

对广泛的人类颈动脉斑块进行单细胞RNA测序,提供了各种细胞类型及其表型的详细细胞图谱,包括不同的内皮细胞和平滑肌细胞簇。

巨噬细胞和T细胞的染色质可及性在单细胞水平上被绘制出来,并确定了相关的转录因子结合位点。

将全基因组关联研究鉴定到的心血管易感基因映射到细胞亚群,确定了潜在的细胞特异性靶点。

正文

动脉粥样硬化以慢性脂源性血管炎症为特征,是心血管疾病(CVD)的主要病因。许多研究基于单个或几个标记蛋白定义人类动脉粥样硬化的细胞图谱,但缺乏对参与动脉粥样硬化病理生理过程的细胞的详细描述。此外,全基因组关联研究(GWAS)已经确定了许多与心血管疾病风险增加相关的基因位点,但由于缺乏关于动脉粥样硬化斑块中特定细胞群落的信息以及疾病部位成药候选基因的细胞特异性表达模式,这些研究结果转化为新的治疗方法受到了阻碍。

英文题目:MicroanatomyoftheHumanAtheroscleroticPlaquebySingle-CellTranscriptomics

发表期刊:CirculationResearch影响因子:14.原文链接:
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